Het beveiligen van Informatie beschouwt Incontrol als haar core competence. We doen dan ook geen concessies op dit gebied. Incontrol is ontwikkeld volgens de beveiligingsstandaarden die het Centrum voor Informatiebeveiliging en Privacybescherming (CIP) stelt. De applicatieserver bevindt zich in een ISO 27001/2 gecertificeerd datacentrum in Nederland.
Het is ook mogelijk om data on-premise te beheren.
